Un equipo de investigadores chilenos ha logrado un avance histórico para la biotecnología marina al completar el primer ensamblaje híbrido del genoma del congrio colorado (Genypterus chilensis), una especie emblemática y de gran importancia comercial para Chile.
Tras el logro científico se encuentran académicos de la Pontificia Universidad Católica de Chile, de la Universidad Bernardo O’Higgins (UBO), de la Universidad Andrés Bello (UNAB), del Centro de Investigaciones Marinas de Quintay (CIMARQ) de la UNAB, y del Centro Interdisciplinario para la Investigación Acuícola Aplicada, INCAR².
Para descifrar el código, los investigadores utilizaron una estrategia híbrida que combina dos de las tecnologías más avanzadas del mundo: Oxford Nanopore (que permite leer fragmentos de ADN muy largos) e Illumina(que ofrece una precisión extrema en fragmentos cortos). Gracias a esta combinación, el estudio reveló que el genoma contiene 439.89 millones de letras de ADN, y se identificaron 35,029 genes que codifican proteínas, los cuales dictan desde el color de su piel hasta su ritmo de crecimiento. Además, se descubrieron más de 14,000 lncRNAs (moléculas de ARN no codificante), que actúan como «interruptores» que controlan cuándo y cómo se activan los genes en diferentes órganos, como el intestino y el riñón.
«Los hallazgos de este estudio son altamente relevantes porque representan el primer genoma de referencia del congrio colorado (Genypterus chilensis), una especie endémica y de importancia comercial en Chile. Este avance permite pasar desde información fragmentaria, basada en transcriptomas, a una comprensión integral de su arquitectura genética, incluyendo la identificación de más de 35.000 genes codificantes y una gran cantidad de elementos regulatorios como los lncRNAs. En particular, la caracterización de más de 14.000 lncRNAs y su expresión específica por tejido aporta una nueva dimensión en la regulación génica, permitiendo entender cómo se controlan procesos fisiológicos clave como el metabolismo, la inmunidad y la respuesta al estrés», expresó el Académico de la UNAB e Investigador Principal del Centro de Investigación Aplicada, INCAR², Dr. Juan Antonio Valdés.
El estudio también comparó al Congrio colorado con el Congrio dorado (Genypterus blacodes), encontrando una similitud estructural notable, aunque con diferencias específicas en el número de genes que podrían explicar las adaptaciones únicas de cada especie a su entorno.
El congrio colorado es un producto fundamental de la gastronomía y la pesca artesanal en Chile. Debido a su alto valor comercial y su condición de especie nativa, ha sido priorizado en los programas de diversificación de la acuicultura chilena. Sin embargo, hasta ahora, los científicos carecían de una hoja de ruta genética completa para entender cómo mejorar su cultivo. «Desde una perspectiva aplicada, disponer de un genoma de referencia es fundamental para el desarrollo de la acuicultura, ya que facilita la identificación de marcadores moleculares y la implementación de programas de selección genética orientados a mejorar rasgos productivos como crecimiento, resistencia a enfermedades y adaptación ambiental. Asimismo, este recurso contribuye al manejo sustentable de la especie al permitir estudios de diversidad genética y estructura poblacional, aspectos clave para la conservación y explotación responsable de recursos marinos. Finalmente, la alta calidad del ensamblaje genómico y el uso de tecnologías de secuenciación híbrida posicionan este trabajo como una plataforma sólida para futuras investigaciones en biología, evolución y biotecnología de especies marinas, consolidando su impacto tanto científico como productivo», agregó el Dr. Valdés.
Revisa aquí los detalles del estudio «First Hybrid Genome Assembly of the Teleost Fish Red Cusk-Eel (Genypterus chilensis) from Oxford Nanopore and Illumina Reads: Comparative Genomic Analysis of Genypterus Species and Long Non-Coding RNA Tissue-Specific Expression».
